产品简介
性状定位BSA（Bulked segregation analysis）即混合分组分析，是指利用目标性状存在显著差异的两个亲本构建分离群体，在子代分离群体中，选取两组表型极端差异的个体，对每个极端组分别构建DNA混池及高通量测序，通过计算两个混池等位基因频率差异，筛选阈值以上的区间，作为目标性状相关联区间，并进行功能注释，获得与目标性状相关的候选基因。
技术流程
技术参数
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参数 |
BSA |
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DNA要求 |
每个样品DNA在1ug以上 |
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测序平台 |
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测序深度 |
每个亲本测序深度10X以上，每个子代混池测序深度20-50X以上。 |
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样品数量要求 |
两个亲本各取1个样本，每个子代池选择极端性状个体，每个子代池样本数在20-50个以上。 |
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群体要求 |
常用家系群体RILS、F2、BC、DH群体，有参考基因组，且两亲本间目标性状差异显著。 |
结果展示
BSA-性状定位
经典案例
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物种 |
样本情况 |
测序深度 |
发表期刊 |
年份 |
研究内容 |
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黄瓜[1] |
RILs群体材料 |
子代池测序深度30X |
Theoretical and Applied Genetics |
2021年 |
基于BSA定位黄瓜花和卷须形成的关键基因 |
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大豆[2] |
RILs群体材料 |
子代池测序深度30X |
Agronomy-Basel |
2022年 |
基于SSR的遗传图谱与BSA定位相结合，定位大豆两个农艺性状（总花荚数和单株有效荚数）相关的基因。 |
参考文献
[1] Yue Chen, Haifan Wen, Jian Pan, et al. CsUFO is involved in the formation of flowers and tendrils in cucumber. Theor Appl Genet 134, 2141–2150 (2021).
[2] Sun Xia, Sun Xiaohuan, Pan Xiangwen, et al. Identification and Fine Mapping of a Quantitative Trait Locus Controlling the Total Flower and Pod Numbers in Soybean[J]. Agronomy,2022,12(4).
