背景介绍
真核无参转录组测序是指通过Illumina测序平台，对真核生物特定组织或细胞在特性时空状态下转录得到的所有mRNA进行测序，进而拼接组装出unigene的转录本，以unigene为参考序列进行后续分析的转录水平变化提供依据。
分析流程
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转录组 |
无参转录组 |
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数据处理与拼接 |
1.对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理 2.数据产出统计及测序数据的成分和质量评估 3.对转录本进行拼接组装 4.基因功能注释（Nr, Nt, KEGG, GO, KOG, Swissprot, Pfam） 5.对所有unigene进行转录因子注释 6.unigene的GO分类、KOG分类、KEGG分类 7.蛋白编码框（CDS）预测 |
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基因表达水平分析 |
8.基因表达水平分析 9.样本间基因表达水平的相关性分析（>=2个样本） 10.基因差异表达分析（>=2个样本） 11.差异表达基因的GO富集分析（>=2个样本） 12.差异表达基因的KEGG富集分析（>=2个样本） 13.差异表达基因的蛋白质互作网络分析（>=2个样本） |
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基因结构分析 |
14.SNP分析（>=2个样本） |
技术参数
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参数 |
转录组测序 |
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样本要求 |
新鲜植物组织:≥500mg,动物组织:≥300mg,细胞: ≥5×106 |
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RNA要求 |
RNA总量>1ug, RNA浓度≥50 ng/ul , RIN≧6.8 (动物)、6.3（植物、真菌）,OD260/280≧1.8 |
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测序平台 |
Illumina PE150测序平台 |
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数据量 |
6G-12G/样 |
结果展示
转录组拼接序列功能注释分析
基因表达差异分析
差异基因富集分析
