背景介绍:
空间转录组测序技术(Spatial transcriptomics, ST)是联合分析转录本的表达水平和转录本空间位置信息的技术,相较于单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)丰富了基因的空间位置信息;相较于传统的原位杂交技术实现了转录本的高通量测序。空间转录组测序技术自在2020年被《nature method》评为年度技术以来发展迅猛。极智提供空间转录组测序产品使用的主要平台是:Stereo-seq。
技术路线:
分析流程:
应用方向:
挖掘新的细胞标志物和细胞类型
疾病发生过程
组织或器官发育进程
神经科学研究
器官组织异质性研究
技术参数:
平台 |
Stereo-seq平台 |
应用物种 |
人、动物、植物 |
送样组织 |
包埋好的组织块 |
组织运送方法 |
足量干冰运输 |
测序平台 |
DNBSEQ-T7/Illumina |
测序模式 |
PE100/PE150 |
推荐测序数据量 |
100G |