DNA指纹图谱
DNA指纹图谱最早在1985年由英国科学家提出，在人类基因组中存在的多态性极高的区域，可以用于区分不同的个体，就像人的指纹一样，因此称为DNA指纹图谱。
材料选取
遗传背景一致，群体同质性高；尽量减少同一品种不同个体间的遗传差异，需要对品种内位点一致性进行分析，同时需要选择合适的取样量，应包含品种95%以上的遗传变异。
SNP标记筛选原则
标记筛选要求：
多位点性：特异性片段或SNP位点众多且分布广泛。
高变异性:不同的个体或群体有不同的DNA 指纹。
稳定遗传：仍按简单的孟德尔方式遗传。
1. 计算LD，得到r2，作为后续筛选代表性标记基础
2. 将杂合标记转为缺失后，过滤掉缺失标记
3. 过滤低频变异maf<0.2
4. 根据计算的LD，在一个LD 距离内保留1-2个代表性标记（长度可调）
5. 根据群体特征，SNP在基因组上的分布，进一步筛选标记。
根据以上筛选过程获得的标记作为候选核心标记。
SNP标记评估
1) 位点多态性高
筛选多态性高的位点,即PIC值≥0.45。
可以在首选核心标记无法鉴别的情况下，按照PIC 值的高低顺序依次作为备选核心标记。
2) 遗传多样性分析
针对筛选的候选标记进行遗传多样性分析，分析n份品种的遗传距离,目的是保证筛选出的SNP足够区分出n份品种中的任意两份。
DNA指纹图谱构建及展示
经过以上对核心SNP标记的不断调整优化，获得的最终的SNP标记进行区分不同的材料，构建DNA指纹图谱数据库。
最终SNP标记在不同材料中展示形式，如下展示形式一：
展示形式二：
展示形式三：
